Грамматический словарь Зализняка (склонения слова):
Кормчий, кормчие, кормчего, кормчих, кормчему, кормчим, кормчего, кормчих, кормчим, кормчими, кормчем, кормчих
ко́рмчий
-его, м.
1. устар.
Рулевой, управляющий движением судна.
Повернул кормчий корабль, поплыли в сторону. Л. Толстой, Три старца.
Грузы в лодке располагаются посредине, а кормчий с веслом находится позади. Арсеньев, В горах Сихотэ-Алиня.
2. перен. высок.
Руководитель, вдохновитель.
КОРМЧИЙ, его, м.
1. Рулевой, кормщик (устар.).
2. перен. Мудрый руководитель (высок.).
ко́рмчий
КОРМЧИЙ -его; м.
1. Устар. Рулевой, управляющий движением судна.
2. Высок. Руководитель, вождь.
К’ОРМЧИЙ, кормчего, ·муж. (·книж. ·устар. ). Рулевой, управляющий движением судна.
| перен. Руководитель, вдохновитель (·ритор. ).
Так называют рулевого на корабле, и слово это образовано естественным образом от кръма – "корма; рулевое весло".