Грамматический словарь Зализняка (склонения слова):
Автономист, автономисты, автономиста, автономистов, автономисту, автономистам, автономиста, автономистов, автономистом, автономистами, автономисте, автономистах
АВТОНОМ’ИСТ, автономиста, ·муж. (полит.). Сторонник автономии.