Грамматический словарь Зализняка (склонения слова):
Автохтонный, автохтонная, автохтонное, автохтонные, автохтонного, автохтонной, автохтонного, автохтонных, автохтонному, автохтонной, автохтонному, автохтонным, автохтонный, автохтонную, автохтонное, автохтонные, автохтонного, автохтонную, автохтонное, автохтонных, автохтонным, автохтонной, автохтонною, автохтонным, автохтонными, автохтонном, автохтонной, автохтонном, автохтонных, автохтонен, автохтонна, автохтонно, автохтонны, автохтоннее, поавтохтоннее, автохтонней, поавтохтонней
АВТОХТОННЫЙ, ая, ое (спец.). То же, что аборигенный.