Грамматический словарь Зализняка (склонения слова):
Бактериоскопия, бактериоскопии, бактериоскопии, бактериоскопий, бактериоскопии, бактериоскопиям, бактериоскопию, бактериоскопии, бактериоскопией, бактериоскопиею, бактериоскопиями, бактериоскопии, бактериоскопиях