Грамматический словарь Зализняка (склонения слова):
Ватка, ватки, ватки, ваток, ватке, ваткам, ватку, ватки, ваткой, ваткою, ватками, ватке, ватках
ва́тка
-и, ж.
уменьш. к вата; небольшой кусочек ваты.
Глаша вынула из своей укладки бутылочку со спиртом и, намочив ватку, положила лейтенанту на больной зуб. Казакевич, Весна на Одере.
ВАТКА, и, ж. Кусочек медицинской ваты.
ва́тка
ВАТКА -и; ж. Небольшой кусочек ваты. Протереть лицо ваткой с лосьоном.
В’АТКА, ватки, ·жен. (·разг. ).
1. ласк. к вата.
2. Кусочек ваты.