Грамматический словарь Зализняка (склонения слова):
Главком, главкомы, главкома, главкомов, главкому, главкомам, главкома, главкомов, главкомом, главкомами, главкоме, главкомах
главко́м
-а, м.
Сокращение слова главнокомандующий.
главко́м
ГЛАВКОМ -а; м. В речи военных: главнокомандующий.
ГЛАВК’ОМ, главкома, ·муж. (неол. воен.). Сокращение слова главнокомандующий.