Грамматический словарь Зализняка (склонения слова):
Контрассигнация, контрассигнации, контрассигнации, контрассигнаций, контрассигнации, контрассигнациям, контрассигнацию, контрассигнации, контрассигнацией, контрассигнациею, контрассигнациями, контрассигнации, контрассигнациях
КОНТРАССИГНАЦИЯ, контрассигнации, ·жен. (от ·лат. contra — против и assigno — ставлю печать) (офиц. ·загр. ). Подпись, скрепа министра на акте, исходящем от главы правительства, означающая, что ответственность за этот акт падает на министра.