Грамматический словарь Зализняка (склонения слова):
Контрафагот, контрафаготы, контрафагота, контрафаготов, контрафаготу, контрафаготам, контрафагот, контрафаготы, контрафаготом, контрафаготами, контрафаготе, контрафаготах
контрафаго́т
-а, м.
Самый низкий по регистру деревянный духовой музыкальный инструмент, звучащий на октаву ниже фагота.
[итал. contra-fagotto]
контрафаго́т
КОНТРАФАГОТ -а; м. [итал. contra-fagotto] Самый низкий по регистру деревянный духовой музыкальный инструмент, звучащий на октаву ниже фагота.