Грамматический словарь Зализняка (склонения слова):
Коренья, кореньев, кореньям, коренья, кореньями, кореньях
КОРЕНЬЯ, ьев. Корни нек-рых корнеплодов, употр. в пищу. Суп с кореньями.
| прил. кореньевый, ая, ое. К. нож (для чистки кореньев).
коре́нья
КОРЕНЬЯ -ньев; мн. Подземные части и зелень некоторых растений (моркови, петрушки, сельдерея и т.п.), употребляемые в пищу. Суп с кореньями.
КОР’ЕНЬЯ, кореньев, ед. нет. Корни некоторых корнеплодов (моркови, петрушки, сельдерея). Суп с кореньями.