Грамматический словарь Зализняка (склонения слова):
Магнетон, магнетоны, магнетона, магнетонов, магнетону, магнетонам, магнетон, магнетоны, магнетоном, магнетонами, магнетоне, магнетонах
МАГНЕТ’ОН, магнетона, ·муж. (физ.). Элементарное количество магнетизма (по аналогии с электроном).