Грамматический словарь Зализняка (склонения слова):
Макрокефалия, макрокефалии, макрокефалии, макрокефалий, макрокефалии, макрокефалиям, макрокефалию, макрокефалии, макрокефалией, макрокефалиею, макрокефалиями, макрокефалии, макрокефалиях
макрокефа́лия
МАКРОКЕФАЛИЯ см. Макроцефалия.
МАКРОКЕФ’АЛИЯ, см. МАКРОКЕФ’АЛ.