Грамматический словарь Зализняка (склонения слова):
Протопресвитер, протопресвитеры, протопресвитера, протопресвитеров, протопресвитеру, протопресвитерам, протопресвитера, протопресвитеров, протопресвитером, протопресвитерами, протопресвитере, протопресвитерах
протопресви́тер
-а, м.
Звание главного священника в военном и придворном ведомстве в дореволюционной России, а также лицо, носившее это звание.
протопресви́тер
ПРОТОПРЕСВИТЕР -а; м. В православной церкви: священник высшего чина (протоиерей) в некоторых главных соборах, а также в военном и придворном ведомствах.
ПРОТОПРЕСВ’ИТЕР, протопресвитера, ·муж. (церк. ·дорев. ). Звание главного священника в большом соборе или в военном, придворном ведомстве. см. прото.... Придворный протопресвитер. Протопресвитер московского Успенского собора.