Грамматический словарь Зализняка (склонения слова):
Сепаратный, сепаратная, сепаратное, сепаратные, сепаратного, сепаратной, сепаратного, сепаратных, сепаратному, сепаратной, сепаратному, сепаратным, сепаратный, сепаратную, сепаратное, сепаратные, сепаратного, сепаратную, сепаратное, сепаратных, сепаратным, сепаратной, сепаратною, сепаратным, сепаратными, сепаратном, сепаратной, сепаратном, сепаратных, сепаратен, сепаратна, сепаратно, сепаратны, сепаратнее, посепаратнее, сепаратней, посепаратней
сепара́тный
-ая, -ое.
Отдельный, обособленный.
Сепаратная группа.
||
Ведущийся отдельно, обособленно.
Сепаратные попытки довести свое личное положение до известного уровня существовали с незапамятных времен. Салтыков-Щедрин, Итоги.
[лат. separatus]
СЕПАРАТНЫЙ, ая, ое; тен, тна. Отдельный, обособленный от других. Сепаратное совещание. С. мир (заключённый отдельно от военных союзников).
| сущ. сепаратность, и, ж.
сепа́ратный
СЕПАРАТНЫЙ -ая, -ое. Отдельный, обособленный от других. С-ая коалиция. С-ые переговоры. С-ая таможенная политика. С. мир (заключённый в нарушение обязательств по отношению к союзнику или союзникам, вне зависимости от них).
◁ Сепаратно, нареч. Вести переговоры с. Сепаратность, -и; ж. С. соглашения.
СЕПАР’АТНЫЙ, сепаратная, сепаратное (от ·лат. separatus — отделенный) (·книж., полит.). Отдельный, обособленный от других. Сепаратное решение. Сепаратные действия, переговоры. Сепаратное выступление. «Она (русская буржуазия) боялась, что царизм, чтобы спасти свое положение, может пойти на сепаратный мир с немцами.» История ·ВКП(б).
Это слово, означающее "обособленный от других", было заимствовано из латинского, в котором separatus образовано от глатадажрагаге – "отделять".