Грамматический словарь Зализняка (склонения слова):
Стоматит, стоматиты, стоматита, стоматитов, стоматиту, стоматитам, стоматит, стоматиты, стоматитом, стоматитами, стоматите, стоматитах
стомати́т
-а, м. мед.
Воспаление слизистой оболочки полости рта.
[От греч. στόμα, στόματος — рот]
стомати́т
СТОМАТИТ -а; м. [от греч. stoma (stmatos) — рот] Мед. Воспаление слизистой оболочки полости рта.
СТОМАТ’ИТ, стоматита, мн. нет, ·муж. (от ·греч. stoma-рот) (мед.). Воспаление слизистой оболочки рта.