Грамматический словарь Зализняка (склонения слова):
Эстандарт-юнкер, эстандарт-юнкеры, эстандарт-юнкера, эстандарт-юнкеров, эстандарт-юнкеру, эстандарт-юнкерам, эстандарт-юнкера, эстандарт-юнкеров, эстандарт-юнкером, эстандарт-юнкерами, эстандарт-юнкере, эстандарт-юнкерах
ЭСТАНДАРТ-ЮНКЕР, эстандарт-юнкера, ·муж. (·иностр.) (воен. ·ист. ). Военное звание в кавалерии, соответствующее подпрапорщику.