Грамматический словарь Зализняка (склонения слова):
Вершок, вершки, вершка, вершков, вершку, вершкам, вершок, вершки, вершком, вершками, вершке, вершках
вершо́к
1)
-шка, м.
Русская мера длины, равная 4,4 см, применявшаяся до введения метрической системы.
◊
- от горшка два вершка
2)
см. вершки.
ВЕРШОК, шка, м. Старая русская мера длины, равная 4,4 см. На в. от гибели (перен.: о грозящей гибели). От горшка два вершка кто-н. (о том, кто ещё очень мал; разг. шутл.).
| прил. вершковый, ая, ое.
ВЕРШОК
1. ВЕРШОК, -шка; м.
1. Старинная русская мера длины, равная 1/16 аршина или 4,4 сантиметра (применялась до введения метрической системы).
2. О самом незначительном пространстве, расстоянии и т.п. Обыскать каждый в. На в. от гибели (о грозившей гибели). Стоять в двух вершках от чего-л. * От горшка два (три) вершка (погов.: шутл.; о том, кто ещё очень мал).
◁ Вершковый, -ая, -ое.
2. ВЕРШОК см. Вершки.
ВЕРШ’ОК, вершка, ·муж.
1. Русская мера длины — около 4,4 ·см, употреблявшаяся до введения метрических мер. В аршине 16 вершков. Ростом он был пяти вершков (·т.е. двух аршин и пяти вершков).
| Очень маленькое, незначительное пространство, длина. — Ни одной пяди чужой земли не хотим. «Но и своей земли, ни одного вершка своей земли не отдадим никому.» Сталин.
2. Верхняя часть чего-нибудь. Мне вершки, тебе корешки. ·нар. сказка.
Образовалось с помощью суффикса "ок" от слова верх, а современное значение (мера длины, равная приблизительно 4,5 см) развивалось, видимо, так: от верхушки – к небольшому излишку, который образуется наверху, когда насыпают зерно, а затем к мере длины.