Грамматический словарь Зализняка (склонения слова):
Генерал-аудитор, генерал-аудиторы, генерал-аудитора, генерал-аудиторов, генерал-аудитору, генерал-аудиторам, генерал-аудитора, генерал-аудиторов, генерал-аудитором, генерал-аудиторами, генерал-аудиторе, генерал-аудиторах