Грамматический словарь Зализняка (склонения слова):
Клепсидра, клепсидры, клепсидры, клепсидр, клепсидре, клепсидрам, клепсидру, клепсидры, клепсидрой, клепсидрою, клепсидрами, клепсидре, клепсидрах
КЛЕПС’ИДРА, клепсидры, ·жен. (·греч. klepsydra) (·ист. ). Водяные часы, измеряющие время по количеству вытекшей из резервуара воды, употреблявшиеся до изобретения современных часов.