Грамматический словарь Зализняка (склонения слова):
Протограф, протографы, протографа, протографов, протографу, протографам, протограф, протографы, протографом, протографами, протографе, протографах
прото́граф
ПРОТОГРАФ -а; м. [от греч. prōtos — первый, главный и graphō — пишу] Текст, к которому восходит один или несколько текстов более поздних по времени создания.