Грамматический словарь Зализняка (склонения слова):
Тонно-километр, тонно-километры, тонно-километра, тонно-километров, тонно-километру, тонно-километрам, тонно-километр, тонно-километры, тонно-километром, тонно-километрами, тонно-километре, тонно-километрах
то́нно-километр
-а, м. спец.
Единица грузооборота, исчисляемая перевозкой 1 тонны груза на 1 километр.
то́нно-километр
{{тонно-килом{}е{}тр}} -а; м. Спец. Единица грузооборота, исчисляемая перевозкой 1 тонны груза на 1 километр. Учёт тонно-километров.