Грамматический словарь Зализняка (склонения слова):
1. шкипер, шкиперы, шкипера, шкиперов, шкиперу, шкиперам, шкипера, шкиперов, шкипером, шкиперами, шкипере, шкиперах 2. шкипер, шкипера, шкипера, шкиперов, шкиперу, шкиперам, шкипера, шкиперов, шкипером, шкиперами, шкипере, шкиперах
шки́пер
-а, мн. шкиперы и шкипера, м.
1. устар.
Капитан коммерческого судна.
[Барыни] с досадою косились на жен и дочерей голландских шкиперов. Пушкин, Арап Петра Великого.
2.
Командир несамоходного речного судна.
Через два месяца Иван отправился в плавание шкипером баржи и забрал с собой жену. Рыбаков, Екатерина Воронина.
3.
Лицо, ответственное за палубное имущество на морских судах.
[голл. schipper]
ШКИПЕР, а, мн. ы, ов и а, ов, м.
1. Капитан несамоходного судна.
2. Капитан коммерческого судна (устар.).
3. На морских судах: лицо, ответственное за палубное имущество.
| прил. шкиперский, ая, ое.
шки́пер
ШКИПЕР -а; мн. шкиперы и шкипера; м. [голл. schipper]
1. Устар. Капитан коммерческого судна.
2. Командир несамоходного речного судна. Ш. баржи.
3. Лицо, ответственное за палубное имущество на морских судах.
◁ Шкиперский, -ая, -ое. Ш-ая каюта.
ШК’ИПЕР, шкипера, ·муж. (·голланд. schipper) (мор.).
1. Капитан коммерческого судна.
2. Должностное лицо на военных судах, ведающее корабельным имуществом.
Это название капитана на коммерческом судне является заимствованием из голландского, где schipper – образовано от schip – "корабль, судно".
< шкив