Грамматический словарь Зализняка (склонения слова):
Настоятель, настоятели, настоятеля, настоятелей, настоятелю, настоятелям, настоятеля, настоятелей, настоятелем, настоятелями, настоятеле, настоятелях
настоя́тель
-я, м.
1.
Начальник мужского монастыря; игумен.
2.
Старший священник собора или приходской церкви.
НАСТОЯТЕЛЬ, я, м.
1. Начальник, управляющий православного или католического мужского монастыря.
2. Старший священник в православной церкви.
| прил. настоятельский, ая, ое.
настоя́тель
НАСТОЯТЕЛЬ -я; м.
1. Начальник мужского монастыря; игумен.
2. Старший священник собора или приходской церкви.
НАСТО’ЯТЕЛЬ, настоятеля, ·муж. (церк.).
1. Начальник мужского монастыря.
2. Старший священник церкви у православных.
Заимствование из старославянского, в котором образовано как калька с греч. epistatos, где epi – "на", states – "тот, кто стоит".